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TET辅助重亚硫酸盐测序(TAB-Seq)

项目介绍


DNA羟甲基化(5hmC)是新发现的一种的修饰碱基,被称为第六碱基。
Bisulfite测序并不能区分甲基化(5mC)和羟甲基化(5hmC),实际上是5mC和5hmC两种修饰的混合信号。
TET辅助重亚硫酸盐测序通过对5hmC进行糖基化保护(免受TET蛋白的氧化),而5mC和C被脱氨基成尿嘧啶,进而可以从单个碱基水平鉴定5hmC。




技术优势

单碱基分辨率的羟甲基化检测工具

相比oxBS, 不需要同时建BS文库

可以实现全基因组或者简化基因组水平检测

技术方法适合所有物种(一般推荐哺乳动物)





科学方案设计

从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析

每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计

及时高效的沟通;以保障高质量研究成果
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样本要求:基因组DNA: >= 5ug;样品浓度>50 ng/ul;无RNA和蛋白污染

建库测序:测序策略:Illumina HiSeq, PE150;测序深度:>=30X, TAB-Seq 文库; 5-10GB, TAB-RRBS 文库

信息分析



基于全基因组范围的羟甲基化分析,

直接进行单碱基5hmC Calling,

5hmC在基因组、染色体、功能元件上的分布,

多样本5hmC差异聚类,

差异DhMR鉴定及相关基因的功能分析,

结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘















用心服务每一个项目

较早开发羟甲基化测序检测技术方法的团队之一
已完成多种肿瘤及哺乳动物羟甲基化测序及oxBS测序分析
助力客户在Genome biology, Epigenetics等杂志发表多篇论文

专业的技术支持,严格的实验把关,丰富的项目经验,高效的沟通机制,用心服务好每一个项目。


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TET辅助重亚硫酸盐测序(TAB-Seq)

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