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液相杂交捕获甲基化测序(Liquid Hybridization Capture-based Bisulfite Sequencing, LHC-BS)是将液相杂交捕获技术和重亚硫酸盐Bisulfite测序技术相结合,对目标序列进行单碱基分辨率的甲基化测序。目前较为商业化的SeqCap Epi CpGiant Enrichment,针对人的启动子及CpG岛区域的产品,覆盖区域为84M,检测3.7M的CpG位点。靶向区域甲基化测序降低了测序通量, 一般测序量为10Gb, 同时检测区域也是甲基化研究的主要目标序列,因此是目前研究基因组甲基化非常有用的方法。
DNA甲基化检测非常有用的工具
靶向测序检测区域更为灵活
单碱基分辨率,检测每个C碱基的甲基化状态
适合所有有参考基因组的物种。
从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析,
每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;
科学、缜密的设计;及时高效的沟通;以保障高质量研究成果。
样本要求:基因组DNA: >= 3 ug;样品浓度>30 ng/ul;无RNA和蛋白污染
建库测序:测序策略:Illumina HiSeq, PE150;测序数据:>=10GB
基于启动子、CpG岛甲基化分析,数据质控、5mC Calling,
多样本甲基化差异聚类,
差异甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析,
结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。
最早探索及设计液相捕获方向进行甲基化研究的团队
已完成多个人启动子液相杂交捕获甲基化测序项目
助力客户在BMC Genomics、Technol Cancer Res Treat、Clinical Epigenetics、Human Reproduction、Scientific reports等权威杂志发表多篇论文。
“专业的技术支持,严格的实验把关,丰富的项目经验,高效的沟通机制”,用心服务好每一个项目。
艾斯基因
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